Comenzando el año 2017 se reanudaron las eliminatorias con las fechas 13 y 14 donde En la fecha 13 cayó por 1-0 contra la selección colombiana en Barranquilla, con un tanto de James Rodríguez tras un penalti fallado, le rebotó el balón y terminó por introducirla al arco quedando matemáticamente eliminado del mundial de Rusia 2018 al quedar con 7 puntos a falta de 5 partidos y en la fecha 14 recibió a Argentina en La Paz, ganándole por 2 a 0, en un partido completamente disparejo, con goles de Juan Carlos Arce y Marcelo Moreno Martins, después visitaron el 31 de agosto a Perú en Lima donde perdieron por 2-1 con goles de Edison Flores y Christian Cueva para los locales y para los del altiplano marco Gilbert Álvarez y el día 5 de septiembre por la fecha 16 recibieron a Chile en La Paz donde vencieron por 1-0 con gol de Juan Carlos Arce acabando el histórico récord que tenía Chile sobre Bolivia en victorias por eliminatorias en La Paz y en octubre en condición de local jugaron frente a Brasil con la que empató sin goles (0-0) y 5 días después cerro su participación de eliminatorias frente a Uruguay con derrota 4-2 quedando en la 9° posición con 14 unidades solamente superando a Venezuela con 12 unidades.
